1. 化疗引起的心脏问题
美国心脏协会曾对乳癌患者发出警告，指化疗和放射性治疗可能导致心脏衰竭、心肌病和其他严重心脏问题，更可能在治疗后数年才发生，但病友不应因此而逃避治疗，协会建议化疗后的乳癌患者可透过定期而持久的健康饮食来减少心脏疾病风险。
另有研究报告亦指，某些化疗药会对心脏带来不良的影响，包括：Anthracyclines、Mitoxantrone、Paclitaxel、Docetaxel、Trastuzumab (Herceptin)、Pertuzumab(Perjeta) 等。故最好在化疗前先测试心脏功能，化疗期间亦要由医生密切监察情况，服用量亦不应超出建议的最高累积剂量。
还有一个乳癌常用的化疗药物：Cyclophosphamide (Endoxan®癌得星)，在高剂量(>100mg/kg/day)的情况下，有可能会造成急性心肌病变并导致心衰竭，只是这样的剂量通常用于血液肿瘤或是骨髓移，乳癌所需的治疗剂量则远低于此。
2. 焦虑、忧郁、疲倦、疼痛
化疗期间，虽然药物不会影响情绪，但始终化疗是一件令人有压力的事，患者出现惊恐、失控、哭泣等情绪问题都是很正常的，至于是否需寻求心理医生协助，则须视乎病友的个别情况。其实家人、同路人、社工都可为病友提供情绪疏导支援，但若出现自杀倾向，当然要向心理医生求助。
3. 认知功能
小部分乳癌患者在化疗后出现认知功能下降，即「化疗脑」(Chemo Brain)的问题。主要表现为学习能力下降、记忆力损害、语言障碍、注意力减退、执行能力减低等。科学家发现，这些情况是因有些化疗药物在治疗后仍会影响脑细胞，甚或诱发中枢神经系统退化，亦有可能是与治疗相关的疲劳、忧郁及焦虑所造成。部分患者很快出现这种情况，但持续较短的时间；有些人则会有较长期的变化，惟现时仍未确定成因。
遇到此问题的病友，可尝试以下活动以提升生活质素：
i. 简单过生活，别尝试一次做太多事情
ii. 详列每天需要做的事及摆放东西的位置
iii. 重复叙述，增加印象
iv. 找安静的地方与人交谈
v. 多吃蔬菜有助大脑健康，还要经常运动，有充足的休息和睡眠
vi. 可多玩猜字、数独、拼图或学习新的语言，保持头脑灵活
4. 淋巴水肿
淋巴系统是身体内的淋巴液经淋巴管道流动到分布全身的淋巴结，把有害的细菌及病毒过滤及消灭，保护身体免受感染。而淋巴结主要集中在关节部位，如腋下、腹股沟、腹部、胸部和颈部周围。当淋巴系统出现一些物理性的障碍，积聚的淋巴液会因过大的渗透压力，从淋巴管流到皮肤层，形成淋巴水肿。
淋巴水肿是慢性病症，可在接受乳房治疗后几个月甚或几年后出现，而乳房腋下淋巴结廓清手术(Axillary lymph node dissection)或放射治疗均会令淋巴结受损，从而阻碍淋巴液流动。早期征状有：上臂感觉疼痛、上肢外观有异等。淋巴水肿是无法根治的，但可控制肿胀及减低患蜂窝组织炎的风险，而改善肢体活动功能、物理治疗和按摩引流，都有助改善不适。
5. 骨质疏松
乳癌患者有机会要进行化疗，有部分病友的卵巢功能可能会因化疗而出现退化的现象。仍然有经期的女性，若乳癌肿瘤荷尔蒙受体为阳性，便可能要使用抑制荷尔蒙制剂或是单一雌性素接受体抑制剂，使脑下垂体无法分泌性腺激素，进一步让卵巢无法分泌雌激素，来控制及治疗病情。
无论停经前后，使用荷尔蒙抑制剂进行治疗的病友，都会有骨骼肌肉酸痛与骨质疏松的问题，所以要注意预防骨质疏松。
要预防骨质疏松可以多接触阳光及吸收维他命D，并多进行有氧及负重运动，辅以肌力训练，有助增加骨质密度。饮食方面建议进食含钙质的食品，如黑芝麻及虾米等，也要吸收好的蛋白质，如牛肉、鸡蛋、绿色蔬菜，以及海产之类等。